Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxo38Q8BMI0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms