Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc172Q810N9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms