Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prima1Q810F0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prima1Q810F0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms