Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SnupnQ80W37 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms