Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rims3Q80U57 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rims3Q80U57 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms