Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clec18aQ7TSQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec18aQ7TSQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms