Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brd2Q7JJ13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms