Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms