Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms