Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LcorQ6ZPI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms