Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ift172Q6VH22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift172Q6VH22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms