Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300aQ6SJQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300aQ6SJQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd300aQ6SJQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300aQ6SJQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms