Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc57Q6PHN1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms