Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab2Q6PAM0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab2Q6PAM0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms