Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhod1Q6P9Q4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms