Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slf2Q6P9P0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms