Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms