Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga3Q6NZL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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