Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpdc1Q6NZK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpdc1Q6NZK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms