Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fbxo41Q6NS60 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fbxo41Q6NS60 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbxo41Q6NS60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbxo41Q6NS60 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms