Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn11Q6J756 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms