Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam196bQ6GQV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam196bQ6GQV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam196bQ6GQV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms