Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rftn1Q6A0D4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rftn1Q6A0D4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms