Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzrn3Q69ZS0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzrn3Q69ZS0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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