Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk13Q69ZA1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk13Q69ZA1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms