Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fnip1Q68FD7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms