Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgefl1Q68EF8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms