Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Papd5Q68ED3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Papd5Q68ED3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Papd5Q68ED3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms