Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CilpQ66K08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CilpQ66K08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms