Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f3Q63955 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f3Q63955 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms