Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms