Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp1Q62442 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms