Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff3Q62395 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms