Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn1Q62261 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn1Q62261 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms