Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sycp1Q62209 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms