Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf4Q60793 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms