Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a1Q60737 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms