Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P4ha1Q60715 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P4ha1Q60715 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms