Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CttnQ60598 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CttnQ60598 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CttnQ60598 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1096.7 ms