Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sin3aQ60520 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms