Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdcp1Q5U462 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms