Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mfsd3Q5U419 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mfsd3Q5U419 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mfsd3Q5U419 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mfsd3Q5U419 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Mfsd3Q5U419 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd3Q5U419 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd3Q5U419 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms