Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms