Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TefmQ5SSK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TefmQ5SSK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms