Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bod1Q5SQY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bod1Q5SQY2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms