Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms