Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms