Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtp3Q5QGU6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms