Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Trim41Q5NCC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trim41Q5NCC3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms