Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eme2Q56A04 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms